Oulà! Complexe, tout cela! J'avais pensé pour ma part mixer "poison" avec le premier scénar de "l'image d'une reine", mais là on est un cran au-dessus...
Euh... J'ai bien quelques idées, mais je ne suis pas certain que ça colle.
Les voici :
1) Le village (Melwan, Dearg, comme tu veux)
est contaminé comme dans "poison", sauf que la contamination vient de l'ancienne usine de Verzal, pas de la rivière (qui, du coup, devient une fausse piste). Pour "l'escarmouche finale", tu parles de la fin optionnelle où tout le village s'entretue, ou juste de la confrontation dans la mine avec le magientiste?
Quoi qu'il en soit, la difficulté d'un tel mix est à mon avis d'éviter que les joueurs ne perdent le fil du scénar, ou ne passent à côté de l'ambiance.
En effet, l'aspect "désorientation" de Loch Varn est tellement important qu'il risque d'éclipser l'aspect "contamination flippante et inéluctable" de Poison. En effet, combattre une épidémie est comme une course contre la montre, en un peu plus flippant (parce qu'on peut soi-même être contaminé). Cela suppose donc une progression temporelle assez linéaire et constante, afin que la pression monte avec le temps qui passe. Or, Loch Varn est justement caractérisé par une temporalité "cassée"...
2) Tu fais les trois scénarios, mais en les liant plus étroitement. Typiquement, le magientiste de Poison (dont j'ai oublié le nom) et Dame Mac Lyr appartiennent à une loge magientiste. Cette loge a appris par un biais quelconque que la région était riche en flux fossile (Dame Mac Lyr a pu remettre la main sur de vieilles notes de Verzal et être en contact avec Alban, par exemple), et agit dans l'ombre depuis...
Du coup, ce n'est plus le flux fossile, mais bien le complot de la loge qui est au centre de tout.
Exemple : Dame Mac Lyr, appartenant à la loge de la Pierre d'Ambre, fait appel aux ressources de la loge lorsqu'elle découvre que son domaine est riche en flux fossile. La loge envoie un magientiste (celui de Poison), son apprenti ainsi que des mercenaires pour escorter le tout, et exécuter les basses oeuvres.
Ce sont ces mercenaires qui auront pris contact avec Alban dans Automne Rouge, et l'auront "influencé" sur demande de leurs employeurs (qui espèrent bien qu'Alban retrouve la Pierre d'Ambre, mais ignorent qu'il l'a déjà trouvée). De même, une petite partie de ces mercenaires accompagne le Magientiste de Poison (dont j'ai oublié le nom), tandis que l'autre partie (dont fait partie le frère de Liam) ont été envoyés en exploration de la vieille usine magientiste de Verzal, dans l'espoir de remettre la main sur ses travaux.
Dans chacun des trois scénars, tu donnes des indices supplémentaires faisant comprendre que chaque évènements extraordinaire (et désagréable) survenu dans la région cache en fait des agissements de la loge, donc de Dame mac Lyr...
Genre :
- Scénar 1 : automne rouge : les pjs apprennent qu'Alban fricotait avec de mystérieux contacts... (qui sont en réalité les mercenaires rheizites au service de la loge)

comprennent que des individus louches ont tiré les ficelles de cette histoire, mais ne savent pas encore qui.
- Scénar 2 : poison : Les pjs sont confrontés avec le magientiste et ses mercenaires. Les Pjs comprennent que ces mercenaires sont les mêmes que ceux qui ont influencé Alban dans "automne rouge". (parce que le frère d'Alban reconnaît l'un d'eux, par exemple). Du coup, quand ils en terminent avec le magientiste, ils croient le problème réglé.
- scénar 3 (optionnel) : mots vengeurs: c'est le moment de caser "mots vengeurs" si tu as envie de variation : devant l'impuissance des démorthèn à soigner la population dans "poison", le conseil du village envoie les pjs prendre contact avec le petit monastère, réputé pour la qualité de sa science médicale, afin qu'ils ramènent de l'aide (sous forme d'un moine, ou de médicaments). C'est d'ailleurs peut-être cette remise en cause de l'autorité démorthèn qui poussera Deorn à s'exciter dans le scénar suivant...
- Scénar 4 : Loch Varn : en affrontant les mercenaires rheizites dans l'usine, les Pjs comprennent que le complot va bien plus loin que l'action d'un magientiste isolé (celui de "poison"). Quelqu'un d'autre tire les ficelles... Et les pjs finissent par découvrir qui, de la bouche de frère de Liam (ses dernières paroles...), ou dans une lettre que possède un des mercenaires : il s'agit de Dame Mac Lyr!
Mais comment arrêter une noble, alors qu'on est soi-même de basse exraction? Il faut des preuves solides! Mais, au fait, Sire Mac Lyr ne vient-il pas de décéder dans des circonstances mystérieuses? Et si elle n'était pas étrangère à cette mort? En effet, ce crime lui profiterait puisque, son mari décédé, elle aurait le champ libre pour contrôler la région, et permettre à ses potes magientistes de s'adonner à leurs activités sans être inquiétés...
Et hop, tu as ton scénar suivant...
Bien sûr, une fois Dame Mac Lyr "éliminée" (sans doute en faisant appel à la justice ducale ou royale, d'où encore un autre scénar), la fameuse loge existera encore, et pourra réapparaître dans un scénar futur...
J'espère avoir pu t'aider, et que ces propositions ne sont pas trop "à côté de la plaque"!